شیرو یک پسر جادوگر جوان هست که تصمیم میگیرد در آکادمی جادوگران هومورا شرکت کند. شیرو پس از ورود به آکادمی وارد نبردی سخت و سرنوشت ساز میشود که...

داستان در سال 2015 در زمانی که جادو هنوز کنترل همه چیز را برعهده داشت اتفاق می افتد. سازمان امنیت و بقای بشریت به نام Chaldea تاسیس می شود تا دنیایی که فقط با جادو قابل دیدن و فقط با علم قابل اندازه گیری است را نظاره کند و همچنین از انقراض نهایی بشریت جلوگیری کند. به لطف تلاش های محققین بسیاری ، تاریخ انسان ها تا 100 سال در آینده تضمین شده اما ، بدون هیچ اخطاری ، دنیای آینده که تحت نظارت دائم Chaldea بود ناپدید می شود. انقراض انسان ها در سال 2017 مشاهده و تائید شد. دلیل این نابودی در شهری در ژاپن به نام Fuyuki در سال 2004 بود. در این شهر ، یک دنیای غیر قابل نظارت بوده که تا حالا هرگز وجود نداشته. Chaldea به محفل بزرگ دستور یک اردوی جام مقدس می دهد تا درباره دلیل انقراض بشریت تحقیق کنند ، پیدایش کنند و درصورت امکان نابودش کنند !